主要性能和指标:
1.测序原理:利用纳米孔电流信号变化识别碱基序列。可直接进行RNA和DNA测序,同时识别碱基修饰,如m5C,m6A等;且精度更高。
2. 可同时运行5张独立的芯片,每张芯片单独控制运行。
3. 读长理论最长≥4Mb,读长无限制,有多长测多长。
4. 测序准确度:单分子测序97%;30X覆盖度 99.99%。
5. 实时测序,运行后10分钟内可获取约5X测序量。
主要功能和服务范围:
该设备利用纳米孔导入核酸序列,根据各种碱基(包括其上甲基化修饰在内)的电阻值不同,将通过纳米孔所引起的电信号变化识别为碱基序列,对DNA和RNA分子进行高通量单分子实时测序。适合各种样本,包括动植物基因组、微生物基因组DNA和RNA测序;集成高性能数据处理减少了对复杂IT基础设施的需要;长读长可提高对重复区域,结构变异,定相等的分析。
该设备是目前唯一可对mRNA转录组进行直接测序的平台。通过mRNA转录组直接测序,可以获得与表观遗传学息息相关的PolyA尾长度、mRNA可变剪接、mRNA甲基化修饰等信息,分析这些信息可从更新更全面的角度揭示植物病害及预防在基因水平的原理机制。
厂家型号:
英国 Oxford Nanopore Technologies ,型号 GridION